畜禽的疫病很多，有的有疫苗预防，有的则没有，因此必须依靠药物预防某些疫病。在饲料、饮水中加入某种安全的药物进行集体预防，在一定时间内可以使受威胁区的易感动物不受疫病的危害，这也是预防和控制畜禽传染病的有效措施之一。

目前使用的预防药物有活菌制剂、化学药品、抗生素、中草药等，如促菌生可预防仔猪黄痢、白痢，禽沙门菌病和大肠杆菌病等；土霉素可预防猪菌痢。但长期使用抗生素添加剂，容易导致耐药菌株的产生而影响此类药物的治疗效果；同时还可导致机体内正常菌群的紊乱而引起一些不易治愈的疾病。国际上已不允许使用医用抗生素作为饲料添加剂，我国目前有规定，不能选用抗生素作为饲料添加剂，如泰乐菌素、螺旋霉素、竹桃霉素、林可霉素等。