一年生的银杏树苗在夏季最容易出现的是根腐病，高温加上田间积水或土壤水分过高，易感染根腐病。得根腐病后，根系皮层腐烂，用手很容易抹掉，其后果是造成全株枯死，若是这种情况，则应立即开沟排水，降低土壤水分，与此同时，可用多菌灵或敌克松或硫酸亚铁与干净细河沙或细土以1∶（20～50）比例混合均匀撒于病株根际及其周围土面；晴、阴天施药以喷雾方式为主，主要药剂为甲基托布津500倍液或敌克松500倍液；另外1∶1∶（100～160）倍波尔多液、200～500倍多菌灵液、600倍液百菌清液对健康银杏幼苗的保护作用明显。死苗的另一原因可能是蝼蛄或蛴螬咬根致死，可以扒开根际土壤查证一下，如是这种害虫为害，可用豆饼粉炒香，按1％比例加入敌百虫结晶拌匀作毒饵，撒于土表诱杀，或用500倍浇根杀灭。