气生菌丝是指从基内伸向空气中的菌丝体。正常的菌丝多为匍匐在基质上生长的，但是有几种情况下，会产生气生菌丝，如由营养生长转向生殖生长时，会出现气生菌丝，特别是为了形成孢子前，会出现气生菌丝；在空气中温度过高时，也会出现气生菌丝；基内营养中氮素过多时，也会出现气生菌丝，是一种徒长的表现；有些食用菌特性容易出现气生菌丝，如双孢蘑菇有气生型和匍匐型，就是指菌丝是气生型的。在食用菌生产中，把气生菌丝多少作为质量指标的一个内容，一般情况下，气生菌丝多表示质量差会影响产量，就双孢蘑菇而言，气生型菌种产量较低，但品质较好。